Investigation of genetic structures of coloured horses by mtdna d-loop sequence analysis in Turkey

Basit Öğe Kaydı
dc.authorid0000-0001-6491-9962en_US
dc.contributor.authorKöseman, Abdurrahman
dc.contributor.authorÖzşensoy, Yusuf
dc.contributor.authorErdoǧan, Metin
dc.contributor.authorYaralı, Cevdet
dc.contributor.authorToprak, Burhan
dc.contributor.authorZengin, Kemal
dc.contributor.authorŞeker, İbrahim
dc.date.accessioned2021-06-01T10:32:34Z
dc.date.available2021-06-01T10:32:34Z
dc.date.issued2019en_US
dc.departmentMTÖ Üniversitesi, Akçadağ Meslek Yüksekokulu, Bitkisel ve Hayvansal Üretim Bölümüen_US
dc.description.abstractThe aim of this study was to determine the genetic structure of Coloured horses in Turkey by analysis of the D-loop sequence of mitochondrial DNA (mtDNA). A total of 28 Coloured horses were examined. DNA was extracted from blood samples using DNA isolation kit; 519 bp long mtDNA D-loop region was amplified by PCR and sequenced by capillary electrophoresis system. Population parameters and phylogenetic trees were drawn by using MEGA4 software package. It was also compared with the DNA sequences of horse populations from diffrent countries. In this study, 42 diffrent polymorphism regions and 10 diffrent haplogroups were detected. Additionaly, Tajima D value was found to be -0.31 and population expansion was determined. It was determined that the base diffrences among the horses ranged between 0.000 and 0.032. It was detected that the horses formed diffrent clusters from each other and they were intertwined with the populations of diffrent countries. Moreover, it was also observed that some horses formed their own populations at diffrent points from the other countries’ horses. As a result, it was observed that the genetic structures of horses which used in population were diffrent from each other and they originated from diffrent mothers. According to the results obtained, it is considered that Coloured horses can be a native horse breed of Turkey.en_US
dc.description.abstractBu çalışma, Türkiye’deki Alaca atların mtDNA D-Loop dizi analizi ile genetik yapılarının belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Araştırmada, toplam 28 Alaca at incelenmiştir. Alınan kan örneklerinden DNA izolasyon kiti kullanılarak DNA elde edilmiş ve 519 bp uzunluğundaki mtDNA D-loop bölgesi PZR ile çoğaltılmış ve kapiller elektroforez sisteminde dizileme işlemi yapılmıştır. MEGA4 paket programı kullanılarak populasyon parametreleri ve filogenetik ağaçları çizilmiştir. Ayrıca farklı ülke at populasyonlarına ait DNA dizileri ile de karşılaştırılması yapılmıştır. Araştırmada, 42 farklı polimorfizm bölgesi ve 10 farklı haplogrup elde edilmiştir. Ayrıca Tajima D değeri -0.31 elde edilmiş ve populasyon genişlemesi olduğu belirlenmiştir. Örnekler arasındaki baz faklılıklarının 0.000 ile 0.032 arasında değiştiği belirlenmiştir. Çizilen filogenetik ağaçlar sonucunda örneklerin birbirlerinden farklı kümeler oluşturduğu ve farklı ülke populasyonları ile de iç içe girdiği belirlenmiştir. Ayrıca, bazı örneklerin farklı ülke atlarından tamamen ayrı noktalarda kendi populasyonunu oluşturduğu da gözlenmiştir. Sonuç olarak çalışılan populasyondaki örneklerin genetik yapılarının birbirinden farklı olduğu ve farklı analardan köken aldıkları görülmüştür. Elde edilen sonuçlara göre; Alaca atların Türkiye’ye ait yerli bir ırk olabileceği düşünülmektediren_US
dc.identifier.citationKöseman, A., Özşensoy, Y., Erdoğan, M., Yarali, C., Toprak, B., Zengin, K., & Şeker, İ. (2019). Investigation of Genetic Structures of Coloured Horses by mtDNA D-loop Sequence Analysis in Turkey. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 25(6), 769-778.en_US
dc.identifier.doi10.9775/kvfd.2019.21844
dc.identifier.endpage778en_US
dc.identifier.issn1300-6045en_US
dc.identifier.issn1309-2251en_US
dc.identifier.issue6en_US
dc.identifier.scopusqualityQ3en_US
dc.identifier.startpage769en_US
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.9775/kvfd.2019.21844
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12899/167
dc.identifier.volume25en_US
dc.identifier.wosWOS:000483012500005en_US
dc.identifier.wosqualityQ4en_US
dc.indekslendigikaynakWeb of Scienceen_US
dc.indekslendigikaynakScopusen_US
dc.institutionauthorKöseman, Abdurrahman
dc.language.isoenen_US
dc.publisherKafkas Üniversitesien_US
dc.relation.ispartofKafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectColoured horseen_US
dc.subjectD-loop regionen_US
dc.subjectHaplogroupen_US
dc.subjectMitochondrial DNAen_US
dc.subjectAlaca aten_US
dc.subjectD-loop bölgesien_US
dc.titleInvestigation of genetic structures of coloured horses by mtdna d-loop sequence analysis in Turkeyen_US
dc.title.alternativeTürkiye’deki alaca atların mtdna d-loop dizi analizi ile genetik yapılarının araştırılmasıen_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Abdurrahman KOSEMAN-Makale Dosyası.pdf
Boyut:
2.53 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Yayın Koleksiyonu
Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu