Diyarbakır ili domates üretim alanlarındaki fitoplazma hastalıklarının moleküler yöntemler ile araştırılması

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorSipahioğlu, Hikmet Murat
dc.contributor.authorYılmaz, Songül Araz
dc.date.accessioned2021-04-02T20:54:12Z
dc.date.available2021-04-02T20:54:12Z
dc.date.issued2020
dc.departmentMTÖ Üniversitesi, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, Bitki Koruma Ana Bilim Dalıen_US
dc.descriptionYÖK Tez No: 639395en_US
dc.description.abstractDiyarbakır ili domates üretim alanlarındaki fitoplazma hastalıklarının belirlenmesi amacıyla 2018 yılında sürvey çalışmaları yürütülmüş ve fitoplazma belirtisi gösteren ve göstermeyen toplam 278 adet yaprak örneği rastgele toplanmıştır. Toplanan örneklerde fitoplazma varlığı, R16mF2/R16mR1 ve R16F2n/R16R2 üniversal primerlerin kullanıldığı Nested qPCR yöntemi kullanılarak araştırılmıştır. Nested qPCR yöntemi ile testlenen örneklerin 7 (%2.5)'sinin fitoplazma etmeni ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. Fitoplazma örneklerine ait 1.250 bp'lik amplifikasyon ürünü 16S rDNA dizilerinin BLAST ve sanal RFLP analizleri sonucunda 7 domates örneğinin 1'i 'Candidatus Phytoplasma solani' (16Sr group XII, subgroup A) ile 6'sının ise 'Candidatus Phytoplasma trifolii' (16Sr group VI, subgroup A) ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. Fitoplazma izolatlarının 16Sr DNA dizilerine yapılan çoklu dizi karşılaştırmasında Diyarbakır izolatlarının dünyadaki diğer fitoplazma izolatları ile %99-100 arasında benzerlik gösterdiği tespit edilmiştir. Yürütülen bu çalışma ile 'Ca. P. solani' ile 'Ca. P. trifolii' Diyarbakır ili domates üretim alanlarında ilk defa rapor edilmiştir.en_US
dc.description.abstractSurvey studies were carried out in 2018 in order to determine phytoplasma diseases in tomato production areas of Diyarbakır, and a total of 278 leaf samples with and without phytoplasma symptoms were collected randomly. The presence of phytoplasma in the collected samples was investigated using the Nested qPCR method using universal primers R16mF2 / R16mR1 and R16F2n / R16R2. It was determined that 7 (2.5%) of the samples tested with Nested qPCR method were infected by phytoplasma agent. As a result of BLAST and virtual RFLP analysis of 16S rDNA sequences of 1,250 bp amplification product of phytoplasma samples, one of the seven tomato samples was identifed as "Candidatus Phytoplasma solani" (16Sr group XII, subgroup A) and remaining 6 were "Candidatus Phytoplasma trifolii" (16Sr group VI, subgroup A). In multiple sequence comparison of phytoplasmal 16S rDNA sequences, it was found that Diyarbakır isolates were shared 99-100% similarity with other phytoplasma isolates in the world. With this work carried out 'Ca. P. solani' and 'Ca. P. trifolii' was reported for the first time in the tomato production areas of Diyarbakır.en_US
dc.identifier.endpage48en_US
dc.identifier.startpage1en_US
dc.identifier.urihttps://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=_F5QEpayDXGqGZlp9XiFtB3BIN0v3kHWkB81_wOTLEpwpZD62uYRf1g_A617wDAt
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12899/96
dc.institutionauthorYılmaz, Songül Araz
dc.language.isotren_US
dc.publisherMTÖ Üniversitesien_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectZiraaten_US
dc.subjectAgricultureen_US
dc.subjectDiyarbakıren_US
dc.subjectDomatesen_US
dc.subjectFitoplazmaen_US
dc.subjectNested qPCRen_US
dc.subjectMoleküler Karakterizasyonen_US
dc.subjectTomatoen_US
dc.subjectPhytoplasmaen_US
dc.subjectNested qPCRen_US
dc.subjectMolecular characterizationen_US
dc.titleDiyarbakır ili domates üretim alanlarındaki fitoplazma hastalıklarının moleküler yöntemler ile araştırılmasıen_US
dc.title.alternativeInvestigation of phytoplasma diseases in Diyarbakir tomato production areas by molecular methodsen_US
dc.typeMaster Thesisen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
00096.pdf
Boyut:
2.06 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir

Koleksiyon

Bitki Koruma Ana Bilim Dalı Koleksiyonu