Yazar "Çelik, Yusuf" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim
    Öğe
    First report of canker and dieback caused by Cytospora viticola on grapevine in Turkey
    (Springer, 2020) Oksal, Erçin; Çelik, Yusuf; Özer, Göksel; Oksa
    Cytospora species are seriously damaging pathogens causing canker and dieback on several woody hosts of agronomic, forestry, and ornamental importance. In June 2018, symptoms of trunk diseases on plants including death of branches, diagnostic chlorotic foliage with necrotic margins, and brownish discoloration inside the wood were observed with an incidence of up to 10% in grapevine (Vitis vinifera L.) fields in the Arapgir district of Malatya. To obtain fungal isolates, necrotic woody tissues were surface disinfected with 1% sodium hypochlorite for 60 s and twice rinsed, air dried, and placed onto 2% malt extract agar (MEA) (Merck, Darmstadt, Germany) amended with tetracycline (0.01%). Petri dishes were incubated at 25 °C in the dark for three weeks. A total of 14 isolates were obtained and identified as Cytospora viticola D.P. Lawr., Travadon & Pouzoulet based on morphological characteristics of white to light straw-coloured colony, dark-brown pycnidia measured 947–1618 ?m in diameter (n?=?20) and pycnidiospores were hyaline, allantoid, aseptate, and ranged from 4.2 to 6.1 ?m in length × 1.1 to 1.8 ?m in width (n?=?50) on MEA (Lawrence et al. 2017). No teleomorphic stage was observed. DNA sequences of Internal Transcribed Spacer (ITS) region, part of the ?-tubulin gene (BT2), and part of the translation elongation factor 1-? gene (EF1-?) from a reference grapevine isolate of C. viticola (Arp2-D) were amplified, sequenced, and deposited in the GenBank database (MK706295, MK715441, and MK715442, respectively). Resultant sequences showed 99–100% identity with those of C. viticola isolate Cyt21 (ITS: KX256244, BT2: KX256223, EF1-?: KX256265). Pathogenicity assays were conducted using disinfected 2-year-old twigs of V. vinifera cv. Köhnü plants inoculated by placing 5-mm-diameter mycelial plugs excised from ten-day colonies into wounds made by removing the bark with a cork borer, while the control plants were inoculated with sterile agar plugs. Inoculated plants were then incubated at 25 °C in a 12-h photoperiod. After 21 days, symptoms of inner bark discoloration were observed in vascular and cortex tissues from which the pathogen was re-isolated successfully to fulfill Koch’s postulates. No symptoms were observed in the control plants. To our knowledge, this is the first report of canker and dieback caused by C. viticola on grapevine in Turkey; the pathogen has been currently reported in the USA and Canada (Lawrence et al. 2017; Farr and Rossman 2019).
  • Küçük Resim
    Öğe
    Malatya ili bağlarında gövde fungal hastalıklarının morfolojik ve moleküler yöntemlerle belirlenmesi
    (MTÖ Üniversitesi, 2019) Çelik, Yusuf; Oksal, Üyesi Erçin
    İklim ve toprak istekleri yönünden çok seçici olamayışı, değerlendirme şekilleri ve çeşit açısından zengin olması nedeniyle Asma (Vitis vinifera) dünyada en yaygın ve en eski kültür bitkilerinden biridir. Bağcılık için dünyanın en elverişli üretim alanlarından biri olan ülkemiz zengin asma gen potansiyeline sahiptir. Bitkisel üretimde önemli bir yere sahip olan bağcılık, günümüzde üretimden pazarlamaya kadar geçen süreç içerisinde bir çok sorunla karşı karşıyadır. Bu sorunlar içerisinde üretimi sınırlandıran fungal hastalıklar önemli yer tutmaktadır. Çalışmada Malatya ili bağ alanlarında kurumalara sebep olan gövde fungal etmenlerinin saptanması amaçlanmıştır. Bu amaçla Malatya ilinde bağcılığın yoğun olduğu Arapgir, Yeşilyurt, Battalgazi ve Darende ilçelerinde vejatasyon peryodu dikkate alınarak iki farklı dönemde örnekleme yapılmış ve hastalık belirtisi görülen bitkilerden numuneler alınmıştır. Çalışmada toplamda 2400 da'lık alanda survey yapılmıştır. Survey sonucu 69 adet enfekteli bitki örnekleri alınmış ve bu bitki örneklerinden 240 adet fungal izolat elde edilmiştir. Fungal izolatların tanısı morfolojik özelliklerine ve moleküler yöntemlere göre yapılmıştır. Moleküler tanılamada ITS, ?-Tubulin, LSU ve TEF-1? primerleri kullanılarak sekans analizleri yapılmıştır. Sekans analizleri sonucu elde edilen dizilerin moleküler tanılamaları NCBI'ın web sayfası ile BLAST analiz programı kullanılarak genbank veri tabanında mevcut olan türlerle benzerlik oranına bakılarak moleküler tanılamaları yapılmıştır. Tanılama çalışmaları sonucunda Botryospharia spp., Phaeomoniella chlamydospora, Fomitiporia mediterranea, Cytospora viticola, Neoscytalidium dimidiatum, Neoscytalidium novaehollandiae, Dothiorella spp., Lasiodiplodia spp. hastalık etmenleri ve birçok saprofit fungus saptanmıştır. Çalışmada Türkiye'de bağlarda ilk kez tespiti yapılan Cytospora viticola ile Neoscytalidium dimidiatum'a ait seçilen birer izolatın patojenite denemeleri yapılmıştır. Teşhisleri yapılan patojenlerden Cytospora viticola bağlarda Amerika kıtasından sonraki ilk tespitidir.