Yazar "Tutkun, Gizem" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 1 / 1
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Olası terapötikler için SARS-CoV-2’nin spike, zarf ve membran proteinlerinin modelleri
    (Malatya Turgut Özal Üniversitesi, 2022) Tutkun, Gizem; Özgen, Ahmet Ozan; Bilge, Uğur
    Amaç: Şiddetli akut solunum sendromu ile ilişkili SARS-CoV-2, yüksek morbidite ve mortaliteye sahip, yaygın, hızla büyüyen bir enfeksiyon hastalığıdır. Bu virüsün üç yapısal proteininin dizisindeki mutasyonlar, pandeminin ilerlemesi üzerinde önemli bir etkiye sahip olabilir.Bu çalışmada, söz konusu SARS-CoV-2'nin beş varyantındaki mutasyonlar modellenip analiz edilerek, gelecekteki ilaç ve aşı araştırmaları için olası hedeflerin ortaya çıkarılması amaçlanmıştır.Materyal ve Metot: DSÖ tarafından Endişe Verici Varyantlar (VoC) olarak tanımlanan beş varyantın RNA dizileri NCBI'den elde edildi. Bu dizilerin amino asit dizisine çevrilmesi, dizi hizalaması ve varyantlar arasında dizi karşılaştırması, 2020 çalışmasına referansla RStudio 1.4.1717'de gerçekleştirilmiştir.Wuhan varyantının yapısal proteinleri ve PDB dosyaları, I-TASSER sunucusu ile yapılan çalışmalardan indirildi. Yapısal proteinlerin 3D görüntüleri LLC, Schrödinger, PyMOL Molecular Graphics System 1.2r3pre'de gerçekleştirilmiştir.Sonuçlar: VoC ve Wuhan soyuna ait üç yapısal proteinin amino asit dizileri ve mutasyonlar gösterilmiştir. Alfa, Beta, Delta ve Gama'daki mutasyon sayıları ise şu şekildeydi; 10, 8, 10 ve 12. Zarf ve zar proteinleri sırasıyla Beta ve Delta'da birer mutasyona sahipti.Sonuçlar: Sonuçlar, SARS-CoV-2 varyantlarının spike proteinlerinde birkaç mutasyon meydana geldiğini göstermektedir. Zarf ve zar proteinlerinde sadece az sayıda mutasyon gözlenir. Gelecekteki aşı ve ilaç geliştirme çalışmaları için daha az mutasyona uğramış yapısal proteinlere odaklanmak faydalı olabilir.