Yazar "Bender, Onur" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 7 / 7
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    A comparative study of Bulgarian and Turkish Asphodeline lutea root extracts: HPLC-UV profiles, enzyme inhibitory potentials and anti-proliferative activities against MCF-7 and MCF-10A cell lines
    (Elsevier, 2015) Lazarova, Irina; Zengin, Gokhan; Bender, Onur; Zheleva-Dimitrova, Dimitrina; Uysal, Sengul; Ceylan, Ramazan; Gevrenova, Reneta
    Asphodeline lutea (L.) Rchb. is a wild plant traditionally used as a food in the Mediterranean region. The alcoholic extracts of A. lutea roots from different origins (Bulgarian and 'Rakish) were investigated for anti-cholinesterase, anti-tyrosinase, anti-amylase, anti-glycosidase and anti-proliferative activity (against MCF-7 and MCF-10A cell lines). A validated HPLC method for the determination of two anthraquinones, two bianthraquinones, two naphthalenes, two flavonoids and one hydroxycinnamic acid was developed due to the presence of these components in the genus Asphodeline. In addition, total anthraquinones content was determined spectrophotometrically. A. lutea from Bulgaria demonstrated higher level of total anthraquinones (0.81 +/-0.05 mg g(-1)). A naphthalene derivative (2-acetyl-1,8-dimethoxy-3-methylnaphthalene) was the major compound in Bulgarian accession (0.96 +/- 0.03 mg g(-1)), while caffeic acid was the main analyte in Turkish sample (0.42 +/- 0.06 mg g(-1)). Turkish extracts were more potent as cholinesterase and tyrosinase inhibitors but less active as antidiabetic agent. The higher anti-proliferative effect was presented by Bulgarian extract with IC50 values 120 +/- 16.8 mg mL(-1) (for MCF-7) and 256 +/- 16.1 mg mL(-1) (for MCF-10A). (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Functional analysis of ESM1 by siRNA knockdown in primary and metastatic head and neck cancer cells
    (Wiley, 2018) Bender, Onur; Gunduz, Mehmet; Cigdem, Sadik; Hatipoglu, Omer Faruk; Acar, Muradiye; Kaya, Mesut; Grenman, Reidar
    BackgroundGenetic factors play a large role in cancer, and thus, there is a great desire to understand the effects of different genes in cancer and to also develop gene therapy for better treatments. Therefore, the development of alternative diagnosis and therapy modalities is of utmost importance. The aim of our study was to illuminate the role of ESM1 (endothelial cell-specific molecule-1, also known as Endocan) in proliferation and migration of head and neck cancer, thus helping to pave the way for new treatment modalities and predictive biomarkers. MethodsESM1 expression was shown with immunofluorescence assay using confocal laser scanning microscope in primary and metastatic head and neck cancer cells. ESM1 expression was knocked down by RNA interference in head and neck cancer cells. Knockdown efficiency was evaluated by quantitative real-time RT-PCR and Western blot. Cell proliferation and migration assays were performed by xCELLigence real-time cell analysis system. ResultsImmunofluorescence assay showed nuclear localization and high expression of ESM1 in primary and metastatic head and neck cancer cells. ESM1 mRNA and protein levels were significantly decreased in ESM1-knockdown cells compared to control. ESM1-knockdown cells showed reduced proliferation and migration activity when compared to control cells. ConclusionThese findings suggest that ESM1 has roles on proliferation and migration of head and neck cancer cells.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Investigating and comparing antioxidant capacity of different region's propolis and their effect on chromosome instability
    (Lippincott Williams & Wilkins, 2015) Ciftci-Yilmaz, Sultan; Akpinar, Zeynep N.; Ceylan, Ramazan; Gunduz, Esra; Bender, Onur; Zengin, Gokhan; Aktumsek, Abdurrahman
    [Abstract Not Available]
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    NF-?B and MAPKs are involved in resistin-caused ADAMTS-5 induction in human chondrocytes
    (Canadian Soc Clinical Investigation, 2015) Hatipoglu, Omer F.; Yaykasli, Kursat O.; Dogan, Mustafa; Yaykasli, Emine; Bender, Onur; Yasar, Tugce; Tapan, Safa
    Purpose: Chronic inflammation is an important etiological factor in the development of arthritic diseases. Several factors contribute to aggregation of chronic inflammation, including the presence of excess adipose tissue. Methods: The putative induction mechanisms of ADAMTS-5 by resistin were investigated in normal primary human articular chondrocytes. Expression levels of the ADAMTS-5 gene were determined at several resistin doses and durations. Results: Human chondrocytes were activated and associated with upregulated ADAMTS-5 gene expression after exposure to resistin (also known as adipose tissue-specific secretary factor, ADSF). Release of ADAMTS-5 leads to joint cartilage degradation, a key event in the development of arthritic diseases rheumatoid arthritis (RA) and osteoarthritis (OA). Activation of chondrocytes was associated with upregulated NF-kappa B protein levels in a time-dependent fashion. Co-incubation of human chondrocytes with JNK and p38 inhibitors lead to abrogated levels of NF-kappa B, indicating that these MAPKs are important in the activation of chondrocytes after stimulation with resistin. Similarly, ADAMTS-5 expression levels were abrogated when co-incubated with p38, NF-kappa B, JNK, MEK and PI3K inhibitors. Our results demonstrate that resistin, released from adipose tissue, may be involved in the development of RA and OA in obese patients through degradation of joint cartilage via ADAMTS-5 released from activated chondrocytes.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Pharmacogenomics in acute myeloid leukemia
    (Springer India, 2013) Hatipoğlu, Ömer Faruk; Bender, Onur; Gündüz, Esra; Gündüz, Mehmet
    Acute myeloid leukemia (AML) is a cancer of the myeloid line of blood cells. In AML, the bone marrow makes many immature cells called blasts, which do not mature and cannot fi ght infections. AML is a heterogeneous neoplasm with several pathological, genetic, and molecular subtypes. Combinations of various doses and schedules of drugs have been the majority of treatment for all types of AMLs in adult patients. However, not all patients have the same response to these treatments, some of which are adverse responses that are potentially life threatening. Because interindividual responses to AML medications can vary considerably, the potential for genetic contributions to variable drug responses is signifi cant. The pharmacogenomics approach tries to fi nd prognostic and predictive biomarkers permitting to identify patients who could benefi t from a particular treatment or those exhibiting higher risks of toxicity. Pharmacogenomics is a rapidly improving science with the potential to revolutionize drug discovery/development and offers one possibility for rationalizing therapy/dose selection. It combines many different fi elds such as genetics, genomics, molecular biology, pharmacology, pharmaceutics, and population biology. This chapter focuses on treatment of AML, genetic and clinical prognostic markers, and recent advances in the fi eld of pharmacogenomics in AML. © 2016 Elsevier B.V., All rights reserved.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Primer ve metastatik baş boyun kanseri hücre hatlarında ESM1 geninin siRNA ile baskılanarak fonksiyonel analizi
    (Turgut Özal Üniversitesi, 2015) Bender, Onur; Gündüz, Mehmet
    Baş boyun kanserleri dünya çapında sık rastlanılan kanser tiplerindendir. Bu durumun sebepleri arasında; hastalık tanısının erken yapılamaması, kanserin metastaz kabiliyetinin ve nüks oranlarının yüksek olması yer almaktadır. Baş boyun kanserlerinde esas tedaviyi cerrahi ve kemoradyoterapi oluştursa da bu yöntemler hastalar üzerinde yaşam standartlarını olumsuz etkileyen deformasyonlara sebep olmaktadır. Tıp ve temel bilimlerdeki teknolojik gelişmeler ile birlikte baş boyun kanserlerinde alternatif tanı ve tedavi yöntemlerinin geliştirilmesi gerekli hale gelmiştir. Bu çalışmada da çeşitli kanser türlerinde aktif rolü olduğu kanıtlanan, tümör büyümesinde, metastazında ve anjiyogenezinde etkileri ortaya konulmuş, kritik bir gen olan ESM1'in baş boyun kanseri üzerine etkileri araştırılmıştır. Çalışmamız kapsamında, baş boyun kanserine ait UT-SCC-74A ve metastazı UT-SCC-74B hücre hatları kullanılmıştır. Hücreler üzerinde ESM1 geninin ekspresyonu immunofloresan boyama ile gösterilmiştir. Kültüre edilen hücrelerin transfeksiyon etkinliği GAPDH-siRNA ile belirlenmiş ve ardından hücrelere ESM1-siRNA transfekte edilerek ESM1 geni baskılanmıştır. Baskılanma düzeyleri kantitatif real time PCR ve western blot analizleriyle gösterilmiştir. ESM1 geninin baş boyun kanseri hücre hatları üzerinde proliferasyon ve migrasyona olan etkileri xCELLigence gerçek zamanlı hücre analiz sistemi ile araştırılmıştır. Aynı zamanda proliferasyon analizlerinin validasyonu için XTT testi, migrasyon analizlerinin validasyonu için ise in vitro scratch assay testi yapılmıştır. Hücrelerin proliferasyon ve migrasyon kinetiklerinin değişimi sırasındaki apoptoz durumu ise kaspaz 3 aktivite analizi ile araştırılmıştır. Çalışmamız sonucunda UT-SCC-74A ve UT-SCC-74B hücre hatlarında ESM1 geni ekspresyonu gösterilmiştir. Hücrelerde ESM1 ekspresyonu ESM1-siRNA kullanılarak anlamlı şekilde baskılanmıştır. Optimal baskılama şartlarında gerçekleştirilen proliferasyon ve migrasyon analiz sonuçlarına göre hem UT-SCC-74A hem de UT-SCC-74B hücrelerinde ESM1 ekspresyonunun baskılanması kanser hücrelerinin büyümesini ve göç kabiliyetini de anlamlı şekilde azaltmıştır. ESM1 ekpsresyonu baskılandığında hücrelerde kaspaz 3 aktivite ölçüm sonuçlarına göre de her iki hücre grubunda da ESM1-siRNA ve kontrol grupları arasında anlamlı bir fark oluşmamıştır. Sonuç olarak; çalışmamız kapsamında ESM1 geninin baş boyun kanser ve metastazlı hücreleri üzerindeki etkileri ortaya konulmuştur. Bu fonksiyonel çalışma ile ESM1 geninin baş boyun kanserlerindeki temel moleküler rolleri belirlenmiş ve bundan sonraki aşamada mevcut agresif tedavilere alternatif olarak ESM1 geni ile yeni moleküler tedavi yöntemlerine temel oluşturulmuştur.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Primer ve metastatik baş boyun kanseri hücre hatlarında ESM1 geninin siRNA ile baskılanarak fonksiyonel analizi
    (Turgut Özal Üniversitesi, 2015) Bender, Onur; Gündüz, Mehmet
    Baş boyun kanserleri dünya çapında sık rastlanılan kanser tiplerindendir. Bu durumun sebepleri arasında; hastalık tanısının erken yapılamaması, kanserin metastaz kabiliyetinin ve nüks oranlarının yüksek olması yer almaktadır. Baş boyun kanserlerinde esas tedaviyi cerrahi ve kemoradyoterapi oluştursa da bu yöntemler hastalar üzerinde yaşam standartlarını olumsuz etkileyen deformasyonlara sebep olmaktadır. Tıp ve temel bilimlerdeki teknolojik gelişmeler ile birlikte baş boyun kanserlerinde alternatif tanı ve tedavi yöntemlerinin geliştirilmesi gerekli hale gelmiştir. Bu çalışmada da çeşitli kanser türlerinde aktif rolü olduğu kanıtlanan, tümör büyümesinde, metastazında ve anjiyogenezinde etkileri ortaya konulmuş, kritik bir gen olan ESM1'in baş boyun kanseri üzerine etkileri araştırılmıştır. Çalışmamız kapsamında, baş boyun kanserine ait UT-SCC-74A ve metastazı UT-SCC-74B hücre hatları kullanılmıştır. Hücreler üzerinde ESM1 geninin ekspresyonu immunofloresan boyama ile gösterilmiştir. Kültüre edilen hücrelerin transfeksiyon etkinliği GAPDH-siRNA ile belirlenmiş ve ardından hücrelere ESM1-siRNA transfekte edilerek ESM1 geni baskılanmıştır. Baskılanma düzeyleri kantitatif real time PCR ve western blot analizleriyle gösterilmiştir. ESM1 geninin baş boyun kanseri hücre hatları üzerinde proliferasyon ve migrasyona olan etkileri xCELLigence gerçek zamanlı hücre analiz sistemi ile araştırılmıştır. Aynı zamanda proliferasyon analizlerinin validasyonu için XTT testi, migrasyon analizlerinin validasyonu için ise in vitro scratch assay testi yapılmıştır. Hücrelerin proliferasyon ve migrasyon kinetiklerinin değişimi sırasındaki apoptoz durumu ise kaspaz 3 aktivite analizi ile araştırılmıştır. Çalışmamız sonucunda UT-SCC-74A ve UT-SCC-74B hücre hatlarında ESM1 geni ekspresyonu gösterilmiştir. Hücrelerde ESM1 ekspresyonu ESM1-siRNA kullanılarak anlamlı şekilde baskılanmıştır. Optimal baskılama şartlarında gerçekleştirilen proliferasyon ve migrasyon analiz sonuçlarına göre hem UT-SCC-74A hem de UT-SCC-74B hücrelerinde ESM1 ekspresyonunun baskılanması kanser hücrelerinin büyümesini ve göç kabiliyetini de anlamlı şekilde azaltmıştır. ESM1 ekpsresyonu baskılandığında hücrelerde kaspaz 3 aktivite ölçüm sonuçlarına göre de her iki hücre grubunda da ESM1-siRNA ve kontrol grupları arasında anlamlı bir fark oluşmamıştır. Sonuç olarak; çalışmamız kapsamında ESM1 geninin baş boyun kanser ve metastazlı hücreleri üzerindeki etkileri ortaya konulmuştur. Bu fonksiyonel çalışma ile ESM1 geninin baş boyun kanserlerindeki temel moleküler rolleri belirlenmiş ve bundan sonraki aşamada mevcut agresif tedavilere alternatif olarak ESM1 geni ile yeni moleküler tedavi yöntemlerine temel oluşturulmuştur.